Una vez acabada la temporada 1997/98 en el Atlético de Ceuta, acaba su carrera deportiva en Ceuta y en el futbol en general, ya que en Ceuta y en las categorías en las que él jugaba era imposible poder subsistir con el salario que les abonaban por lo que casi todos los jugadores tenían un trabajo con el que poder compatibilizar los entrenamientos y los partidos, algo complicado cuando militabas en categorías nacionales, con lo que tenías que desplazarte fuera de la ciudad y en la mayoría de ocasiones pernoctar fuera de Ceuta.
Cuando por motivos laborales, tuvo que dejar Ceuta, se desplaza a Guadalajara y donde comienza su vida laboral, que más adelante la podemos ver, porque la verdad es muy apasionante y empieza su faceta de entrenador, al primer equipo que entrena es a los porteros del Sporting Cabanillas de Tercera División, esto sucedía durante los años 1999 a 2003.
Durante los años 2007 a 2011, entrena a los porteros de las categorías inferiores del C. D. Guadalajara, siendo en total 75 porteros, desde alevines a juvenil nacional y Femenino de División de Honor de Castilla la Mancha.
En el año 2011/2012 abandona el club junto al Director Deportivo Santiago Nuero y colaboran con el R. Madrid, Santiago como ojeador de jugadores y Juanjo como ojeador de porteros del Corredor de Henares. También colabora como entrenador de porteros del C. D. Alovera en categorías Juvenil y Senior Preferente en Castilla la Mancha.
Su peor momento como futbolista, sin duda la grave lesión de Rotura de Clavícula, que tuvo con 18 años, jugando en el Campo de la Marina y por los que tuvo que estar cerca de una temporada fuera de los terrenos de juego.
Por el contrario, su mejor momento deportivo fue cuando fue convocado y debutó con 16 años en el equipo Imperio de Ceuta que militaba en Tercera División.
Los futbolistas que mas le han gustado, en lo que concierne a futbolistas de Ceuta, Paco Casanova, Quero, Cañas, Rafa Peña, Lolo y como no acordarse de un deportista nato como es Luis Coca Cantizano, el cual jugó con cerca de 50 años en Regional Preferente, a un gran nivel en la categoría y que lo hacía a un nivel bastante aceptable, ha sido toda su vida un auténtico deportista.
En cuanto a jugadores de la península, le impresionó la calidad de Santaella, nacido en Ceuta (y al cual le hice su historial deportivo), se enfrentaron cuando jugaba en el Utrera C. F. de Tercera División y tenía una gran entrega y lucha, pero no acabó de dar el salto necesario para demostrar esa clase que poseía.
En cuanto a su mejor compañero dentro del futbol, ha tenido muy buenos compañeros, con los que entablaba una buena amistad, sería injusto que se olvidara de alguno de ellos, por lo que no puede nombrarlos a todos. Como anécdota, resaltar que cuando se cambió a su actual domicilio, en la península, un día vino un chico y le dijo que si era de Ceuta y si había jugado en el Imperio de Ceuta y si lo había echo de Portero, resulta que era Viosca, un jugador del Imperio de Ceuta, que como muchos otros estaba n cumpliendo el servicio militar en Ceuta y con el que jugó varios años, fue increíble porque Juanjo se encontraba en un pueblo de la Alcarria y a más de 1000 km. de Ceuta y se encontró con un antiguo compañero de equipo.
Su opinión acerca del futbol actual en Ceuta: Hace bastante tiempo que no visita Ceuta, pero mantiene contacto con la situación del futbol actual, en la que le es muy grato saber la cantidad de instalaciones que existen en la actualidad. En cuanto al primer equipo de la Ciudad, sigue siendo un equipo inaccesible para la cantera, en eso no ha cambiado nada y se equivocan completamente, de nada les sirve el sacrificio que hacen los futbolistas y entrenadores en las categorías inferiores, si después acuden a un partido de Segunda División B, en el que el 98% son jugadores no locales. De siempre el primer equipo de la Ciudad se ha nutrido de jugadores nacidos en Ceuta y que tan buen resultado ha dado y la historia está escrita con los mayores logros deportivos, como fue el único ascenso a Segunda División A, en donde había hasta 10 futbolistas nacidos en Ceuta y el futuro del futbol en Ceuta está por volver a esos orígenes y que la cantera vuelva a dar esos frutos y el Estadio Alfonso Murube vuelva a vibrar con los jugadores locales.
Lo más amargo y lo más dulce del futbol: Lo más bonito del futbol es la capacidad para hacer que personas de cualquier raza, religión y condición política, trabajen en equipo y se impliquen en el proyecto común, llegando a establecerse amistad con personas que sin utilizar este medio sería bastante improbable.
Lo más amargo sin duda ninguna son las lesiones y las pérdidas humanas de las que tristemente hoy en día están ocurriendo en los terrenos de juego.
Entrenador que guarda mejor recuerdo: En general de todos y cada uno de los entrenadores que ha tenido siempre le han enseñado algo y se han caracterizado por hacer lo mejor posible para el futbolista y el equipo. Pero sin duda ninguna, el entrenador del que guarda mejor recuerdo ha sido paco Casanova del U. D. Velarde.
Relación de Entrenadores en la vida deportiva de Juanjo:
José Baglieto (A. D. Ceuta) - Baldomero Esles (Imperio de Ceuta) - Jaramillo (Imperio de Ceuta) - Paco Conejo (Imperio de Ceuta) – Nono (Selección Norteafricana) - Jaco Zafrani (Imperio de Ceuta) – Paco Casanova (U. D. Velarde) – Paco Conejo (Atlético de Ceuta) – Juan Molina (At. de Ceuta) y pide disculpas si se ha dejado alguno en el camino, sobre todo en sus inicios, ya que no recuerda los nombres.
Juanjo manda un recordatorio para esa persona que tanto dedicó al futbol en Ceuta y que él le está muy agradecido, por su dedicación y buen hacer, el tristemente desaparecido Emilio Cózar, descanse en paz.
En la siguiente y última entrega de este historial, podemos ver la vinculación que existe con la familia Barrientos, tan futbolera en Ceuta y la saga que continúa con su hijo Sergio, Guardameta que ha seguido los pasos de su padre Juanjo.